cutadapt软件对测序数据去接头

本文总阅读量次 2017-06-15

对测序数据进行QC，就三个大的方向：Quality trimming， Adapter removal， Contaminant filtering

cutadapt是经典的python软件,
安装：sudo pip install cutadpat
if error,可以自己去下载cutadapt的源码，然后进入源码文件夹里面 python setup.py install –user 到自己的 ~/.local/bin下面。
or, 用conda安装了cutadapt软件

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缺失模块。
1、请确保node版本大于6.2
2、在博客根目录（注意不是yilia根目录）执行以下命令：
npm i hexo-generator-json-content --save

3、在根目录_config.yml里添加配置：

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