R Summary

1.What is R?
R程序包是多个函数的集合，具有详细的说明和示例。Window下的R程序包是已经编译好的zip包。每个程序包包含R函数、数据、帮助文件、描述文件等。

2.Why install R？
特定的分析功能，需要用相应的程序包实现。
例如：系统发育分析，往往要用到ape程序包，绘图功能通常会用到ggplot2程序包。

3.Where download?
CRAN网站提供全部程序包的源代码和编译好的Windows、Mac版本的程序包

4.矩阵
data.ma <- matrix(1:12,nrow=3,ncol=4,byrow=TRUE)
为行或列添加名称：
colnames(data.ma) = c(“语文”,”数学”,”英语”,”化学”)
rownames(data.ma) = c(“zhang”,”wang”,”li”)

5.常用命定
substr(x,start,stop) #提取一个字符向量的子串
cor.test(data$height,data$weight)
cor(data$height,data$weight)

1. 画图
   plot() 绘制散点图等多种图形
   hist() 直方图
   boxplot() 箱线图
   stripchart() 点图
   barplot() 条形图
   dotplot() 点图
   piechart() 饼图

font= 字体（1常规，2粗体，3斜体，4粗斜体）
lty= 线类型（1实线，2虚线，3虚点线）
lwd= 线宽度
pch= 点的类型
xlab= 横坐标
ylab= 纵坐标
xlim= 横坐标范围
ylim= 纵坐标范围

1. abline

abline(lm(mpg~wt),lwd=2,col=”red”)
计算mpg和wt的线性相关系数，并把相关系数添加到图中
cor.test(mpg,wt)
cor(mpg,wt)

或者
summary(lm(mpg~wt))

text(5,30, labels=expression(R^2==0.75))

向现有图中添加点
points(4,25,pch=15,col=”red”)

直方图
hist(x,breaks=,col=,border=)

。。。。。。

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